о-малое стремится к...
Apr. 18th, 2022 03:19 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
eugenegpКраткий путеводитель по Омикронам (на середину апреля 2022)
Омикрон - вариант (штамм) вируса SARS-CoV-2. Впервые замечен в Ботсване 11 ноября 2021 года, идентифицирован южноафриканскими врачами и учеными. За прошедшее время стал основным циркулирующим вариантом во всем мире. Значительно и резко отличается от всех предыдущих штаммов по своей генетической последовательности и по клиническому течению вызываемой болезни. Предположительно произошел либо в ходе многочисленных мутаций внутри одного организма (болевшего человека или животного), либо в ходе рекомбинации внутри человека с одним старых "человеческих" бета-коронавирусов (вызывающих в настоящее время умеренные респираторные заболевания).
[Рекомбинация - появление нового вируса в результате смешения генетического материала нескольких вирусов-предков, встретившихся в клетке. Немного похоже на половое размножение, но без этого нелепого ограничения всего двумя родителями - в рекомбинации может сразу участвовать несколько вирусов-предков.]
Omicron BA.1 (он же B.1.1.529) - так сейчас обозначается самый первый, оригинальный Омикрон. Он отличается от оригинальского, ханьского-уханьского, 60 мутациями. Среди них 32 генетических изменения в белке, кодирующем спайк, шип на поверхности коронавируса, который вирус использует для входа в клетку человека. Именно и только на создание антител к спайку были нацелены основные вакцины (мРНК и векторные), выпущенные за эти два года. Столь большие изменения привели к дальнейшему, резкому падению их эффективности против Омикрона.
В ходе дальнейшей эволюции Омикрона появились:
Omicron BA.2. Произошел в ходе мутации оригинального Омикрона. 22 марта 2022 ВОЗ объявила BA.2 доминирующим в мире. От BA.1 его отличают еще 28 новых, уникальных генетических последовательностей. 4 из них - в белке, кодирующем спайк. Это дало штамму новые характеристики и преимущества, считается, что он на 30-50% заразнее, чем BA.1.
Omicron BA.3. Произошел в ходе мутации. Сам по себе не получил серьезного распространения и клинических отличий от BA.1.
"Дельтакрон", он же Omicron XD, а также Omicron XF. Два похожих штамма, произошедших от рекомбинации Дельты и Омикрона. Впервые замечен в середине февраля во Франции. В целом генетически очень похож на Дельту, но при этом спайк похож на Омикрон. Всех напугал, но проиграл эволюционное соревнование.
Омикрон XE, рекомбинация BA.1 и BA.2. Обнаружен в Великобритании 19 января 2022. Возможно, на 10-20% заразнее, чем BA.2. Его спайк-белок практически совпадает с BA.2.
Omicron XQ (Великобритания), Omicron XG (Дания), Omicron XJ (Финляндия), Omicron XK (Бельгия) - другие рекомбинации BA.1 и BA.2. Их регистрация отражает только тот факт, что при таком высоком уровне заболеваемости рекомбинации постоянно происходят, а в некоторых странах есть мощности по секвенированию.
Все Омикроны значительно отличаются по клиническому течению от предыдущих штаммов Ковида. Они, как правило, не поражают нижние отделы дыхательных путей, не возникает вирусная пневмония и следующее значительное падение сатурации кислородом, которые являлись основной причиной смерти от Ковида. Однако поражения сосудистой сети (вероятно, реактивно-иммунного характера) все еще встречаются.
Все Омикроны дают перекрестную защиту от повторных заболеваний (возможно, в т.ч. из-за схожести их спайк-белков). Однако эта защита неполная, что неудивительно при таком количестве ежедневных контактов с болеющими. (Например, в Великобритании на сегодня число больных прямо в данный момент оценивается в 5 млн человек при 67 млн населения).
Резюме: Уханьский -~-> Дельта (заразнее на 10-20%) -~~Х--> Омикрон Ba.1 (резкое падение опасности, заразнее в 2 раза) --> Омикрон Ba.2 (заразнее на 30%) -X-> Омикрон XE (заразнее на 10% ? ).
Омикрон - вариант (штамм) вируса SARS-CoV-2. Впервые замечен в Ботсване 11 ноября 2021 года, идентифицирован южноафриканскими врачами и учеными. За прошедшее время стал основным циркулирующим вариантом во всем мире. Значительно и резко отличается от всех предыдущих штаммов по своей генетической последовательности и по клиническому течению вызываемой болезни. Предположительно произошел либо в ходе многочисленных мутаций внутри одного организма (болевшего человека или животного), либо в ходе рекомбинации внутри человека с одним старых "человеческих" бета-коронавирусов (вызывающих в настоящее время умеренные респираторные заболевания).
[Рекомбинация - появление нового вируса в результате смешения генетического материала нескольких вирусов-предков, встретившихся в клетке. Немного похоже на половое размножение, но без этого нелепого ограничения всего двумя родителями - в рекомбинации может сразу участвовать несколько вирусов-предков.]
Omicron BA.1 (он же B.1.1.529) - так сейчас обозначается самый первый, оригинальный Омикрон. Он отличается от оригинальского, ханьского-уханьского, 60 мутациями. Среди них 32 генетических изменения в белке, кодирующем спайк, шип на поверхности коронавируса, который вирус использует для входа в клетку человека. Именно и только на создание антител к спайку были нацелены основные вакцины (мРНК и векторные), выпущенные за эти два года. Столь большие изменения привели к дальнейшему, резкому падению их эффективности против Омикрона.
В ходе дальнейшей эволюции Омикрона появились:
Omicron BA.2. Произошел в ходе мутации оригинального Омикрона. 22 марта 2022 ВОЗ объявила BA.2 доминирующим в мире. От BA.1 его отличают еще 28 новых, уникальных генетических последовательностей. 4 из них - в белке, кодирующем спайк. Это дало штамму новые характеристики и преимущества, считается, что он на 30-50% заразнее, чем BA.1.
Omicron BA.3. Произошел в ходе мутации. Сам по себе не получил серьезного распространения и клинических отличий от BA.1.
"Дельтакрон", он же Omicron XD, а также Omicron XF. Два похожих штамма, произошедших от рекомбинации Дельты и Омикрона. Впервые замечен в середине февраля во Франции. В целом генетически очень похож на Дельту, но при этом спайк похож на Омикрон. Всех напугал, но проиграл эволюционное соревнование.
Омикрон XE, рекомбинация BA.1 и BA.2. Обнаружен в Великобритании 19 января 2022. Возможно, на 10-20% заразнее, чем BA.2. Его спайк-белок практически совпадает с BA.2.
Omicron XQ (Великобритания), Omicron XG (Дания), Omicron XJ (Финляндия), Omicron XK (Бельгия) - другие рекомбинации BA.1 и BA.2. Их регистрация отражает только тот факт, что при таком высоком уровне заболеваемости рекомбинации постоянно происходят, а в некоторых странах есть мощности по секвенированию.
Все Омикроны значительно отличаются по клиническому течению от предыдущих штаммов Ковида. Они, как правило, не поражают нижние отделы дыхательных путей, не возникает вирусная пневмония и следующее значительное падение сатурации кислородом, которые являлись основной причиной смерти от Ковида. Однако поражения сосудистой сети (вероятно, реактивно-иммунного характера) все еще встречаются.
Все Омикроны дают перекрестную защиту от повторных заболеваний (возможно, в т.ч. из-за схожести их спайк-белков). Однако эта защита неполная, что неудивительно при таком количестве ежедневных контактов с болеющими. (Например, в Великобритании на сегодня число больных прямо в данный момент оценивается в 5 млн человек при 67 млн населения).
Резюме: Уханьский -~-> Дельта (заразнее на 10-20%) -~~Х--> Омикрон Ba.1 (резкое падение опасности, заразнее в 2 раза) --> Омикрон Ba.2 (заразнее на 30%) -X-> Омикрон XE (заразнее на 10% ? ).
